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pI/Mw批量计算工具(PItool) 1.0
运行环境:简体中文
软件语言:简体中文
软件类型:国产软件/理科工具 - 教育教学 - 理科工具
授权方式:共享版
软件大小:334 KB
推荐星级:
更新时间:2008-1-16 1:16:10
联系方式:未知
官方主页:http://Home Page
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插件情况:
解压密码:本站默认解压密码:www.windy8.com
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软件简介

本工具可通过互联网向Expasy数据库批量提交蛋白质等电点及分子量计算请求,并即时接收计算结果。

使用方法及技巧
方法一:输入Swiss-Prot蛋白质识别号(ID) (如TVB5_MOUSE PEPC_HUMAN) 或 Swiss-Prot/TrEMBL登录号(AC) (如P04213 P20142),用“空格”分开,或一行一个。
例如:输入以下内容并提交......

按照方法一的方式,只提交一个蛋白质的Swiss-Prot蛋白质识别号(ID)或Swiss-Prot/TrEMBL登录号(AC)时,除返回等电点及分子量外,还将获得有关局部片段参考信息。
例如,输入ALBU_HUMAN并提交,将返回以下内容......

方法二:直接输入蛋白质的序列(单字母)。
例如,输入:

EQLWVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDAKAYDTEVHNIWATHACVPTDPNPQEVVLGNVTENFNMWKNNMVEQMHEDIISLWDQSLKPCVK
LTPLCVTLNCTNLRNDTSTNATNTTSSNRGKMEGGEMTNCSFNITTSIRSKVQKEYALFYKLDVVPIDNT
SYTLINCNTSVITQACPKVSFEPIPIHYCA
将输出以下结果:
Theoretical pI/Mw for the protein sequence
EQLWVTVYYG ... FEPIPIHYCA :

Theoretical pI/Mw: 5.14 / 21386.24

在“方法三”前的复选框内打钩,输入某个蛋白的AC、所求序列片段的起始位置(从N段算起)、结束位置,提交后将返回此片段的分子量及等电点,并配有所求片段的序列及适当的注释。为保证等电点计算的相对准确,片段长度不宜小于5个氨基酸残基。

(详见说明文档)

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